Печеното кафе може долго да стои на полица, но неговиот квалитет со текот на времето се намалува бидејќи ја губи свежината под влијание на воздухот, влагата, топлината и светлината. За да се зачува аромата и вкусот, важно е зрната да се чуваат во добро затворен сад, на ладно, суво и темно место. Кафето содржи природни масла и соединенија кои брзо се разградуваат, па затоа правилното складирање има клучна улога.

Се препорачува да се купува количина што може да се потроши во рок од една до две недели. Неотвореното пакување може да трае до рокот означен на декларацијата, но по отворањето најдобро е кафето да се искористи во рок од две недели за да се задржи најдобриот вкус, иако може да остане прифатливо и малку подолго ако се чува правилно.

Иако може да се чува во оригиналната кеса, подобро е кафето да се префрли во херметички затворен сад со што помалку воздух внатре. Треба да стои на собна температура, подалеку од извори на топлина и директна сончева светлина. Чувањето во фрижидер не се препорачува затоа што кафето лесно впива влага и мириси од другите намирници.

Иако кислородот најмногу влијае на губењето на свежината, високите температури и влагата дополнително го забрзуваат тој процес. Замрзнувањето може да биде опција за подолгорочно чување, но само ако кафето е добро затворено и не се изложува често на промени на температурата. За секојдневна употреба, замрзнувачот не е најдобро решение.

Меленото кафе ја губи свежината побрзо од кафето во зрно бидејќи поголемата површина го забрзува процесот на оксидација. Затоа е најдобро да се меле само количината што е потребна за моментална подготовка, а остатокот да се чува во затворен сад на ладно и темно место и да се потроши во рок од една недела за најдобар вкус.