Lasciò presto il trambusto del mondo e si ritirò in una grotta, dove visse come eremita in ascetismo per quarant'anni. Poi avvenne che la sede episcopale di Iconio era vacante e Anfilochio fu miracolosamente eletto e consacrato vescovo di Iconio. Era un pastore meraviglioso e un grande difensore della pura fede ortodossa. Partecipò al II Concilio Ecumenico del 381. Combatté con zelo contro il malvagio Macedonio e contro gli Ariani e Eunomio. Pregò personalmente l'imperatore Teodosio il Grande di espellere gli ariani da ogni città dello stato. Quando il vescovo fu introdotto nella camera dei ricevimenti, l'imperatore era seduto sul trono e alla sua destra c'era suo figlio Arcadio, che aveva nominato suo co-imperatore. Quando Anfilochio entrò, si inchinò al re Teodosio e non guardò nemmeno Arcadio, il figlio del re, anche se non era lì. L'imperatore Teodosio si arrabbiò molto per questo e ordinò che Anfilochio fosse immediatamente espulso dal palazzo. Oltre a numerose opere e imprese, sant'Anfilochio scrisse anche diversi libri sulla fede. Morì nel 395 in età molto avanzata e passò alla vita immortale.